当初，制造大圣杯的御三家。自然知道大圣杯的力量，特别是大圣杯可以长生不老的能力，在传出去后，有着怎么样的吸引力，御三家不是不知道。特别是在西边的那个神秘的大国的帝王，要是说大圣杯被其他的人知道了，还有回转的余地。要是被那里的人知道了，就是一个后果。
所以在保存大圣杯的方法上，御三家就是使用了最稳妥的办法，就是将大圣杯放置在另一个空间。一个完全和现世隔开的空间。
这样一来只要是大圣杯没有满足条件，就不会出现在这个世界上。而且那个空间也就是当时的御三家的家主，也就是爱因兹贝伦、玛奇里·佐尔根，或者说是间桐脏砚以及远坂永人。
在这里，远坂永人就是可以说一个大傻子。不过当然的也不能说是他傻，而是说他没有另外的两人精明。远坂永人是为了通过大圣杯而进入根源加入到铸造大圣杯的计划里面的。
也因为这个原因，远坂永人没有要太多的大圣杯的数据，或者说是信息。因为大圣杯对于远坂永人来说就是一个工具，一个进入根源的工具。
而另外的两人，可以说是也有自己的小九九。就是大圣杯的运行没有问题，但是实际上来说，对于御三家来说，大圣杯计划可以说是功亏一篑。
大圣杯的仪式过程
1：从地脉吸收魔力
大圣杯从冬木市的地脉中汲取出魔力。若是剧烈地夺取庞大份量的魔力，将会导致地脉的枯竭。因此，必须花费时间慢慢前进。聚集1次圣杯战争所需要的魔力，大约要60年的时间。
2：选定Master
在贮藏了足以召唤七名Servant的魔力后，大圣杯会选出适合成为Master的魔术师，授予“预兆”之痕。候补者们必须迅速开始为召唤Servant的仪式而准备。
3：召唤仪式
召唤Servant需要复杂的魔术仪式。作为原型的英灵和召唤者在精神、肉体上的相性自不言说，但最重要的是和英灵具有深切渊缘的触媒。召唤Servant是人力所不能及的仪式，但大圣杯的辅助让其化为可能。
4：大圣杯的接触
当举行召唤仪式时，大圣杯会连接到位于通常时间轴之外的被称为“英灵之座”的场所、探寻出与仪式中所使用到的触媒相对应的英灵。没有触媒的情况下，会随机选出英灵，但召唤者的性格与境遇等也会造成影响。召唤之时，作为与现界的交换，英灵会被强迫“对令咒绝对服从”。
5：为Master刻上令咒
Master之座先到先得，在七名Servant被召唤的那一刻起，剩余的候补者将失去参加资格。并且，召唤成功者将被授予对应于该Servant的令咒。这令咒的力量来源，同样是大圣杯。
6：召唤Servant
召唤成功后，英灵就以Servant的形式现界。此时，会被分配到7个职阶的某个。原则上1个职阶1名Servant。被分配到哪个职阶，则根据作为原型的英灵的特性来决定。
7：Master与Servant契约
作为Servant留存于现世的“凭依”，Master是必要不可缺的。借助主从契约，双方成为圣杯战争的参战搭档。
8：战争的开始
当集齐7组Master和Servant时，圣杯战争就会开幕。直到只剩最后1组之前战争不会结束，还有只要还遵守最低限度的规则“神秘的隐匿”，这场战争中没有禁止使用的手段。暴力、智略、卑劣的陷阱全都被允许。
9：回收Servant的灵魂
被打倒或者失去Master后无法维持存在的Servant的灵魂，会被小圣杯回收、被扣留直到战争终结之时。收集到的Servant的灵魂，将在大圣杯所执行的仪式的最终阶段中完成重要任务。
10：通往“根源”的路
“根源”，那是所有魔术师的目的地，被认为是存在于世界外侧的“万物之开始与终结、记录这世上的一切、作成这世上的一切的神之座”。冬木市的圣杯战争中，将死去的六名Servant的灵魂注入小圣杯，利用他们回归位于世界外侧的“英灵之座”的力量将世界穿孔，并以大圣杯中积累的庞大魔力来固定这个孔，从而制造出前往世界之外的门。
这就是圣杯战争的真正目的，从系统层面来看，被圣杯可以实现愿望这种鱼饵钓过来的Master们，只不过是Servant所需的凭依，在Servant召唤阶段过去后他们就没有用了。
而最后的在圣杯战争结束后，Master就可以通过许愿看到根源。这个才是御三家想要的。
不过在最初的时候，是没有令咒的。这个也就是导致了圣杯战争功亏一篑的原因之一。
在第一次的圣杯战争的时候，因为Master和召唤而来的英灵的之间的不配合，导致了第一次的圣杯战争的失败。而第二次的圣杯战争就是有着其他的各种各样的原因，导致了圣杯战争的失败。
不过在有着两次的失败的经验后，第三次圣杯战争可以说是非常的成功。但是这个的后果就是大圣杯被污染了。既然被污染了，自然就是没有用了。
而这一次的圣杯战争也就是第三次圣杯战争也被记载为失败。
而现在的凉宫春日看到的此世之恶的痕迹，就是第四次的大圣杯出现后的，此世之恶流露出来的痕迹。而想要进入大圣杯所在的空间，就要空间坐标，或者说找一个进入过空间的人，让长门有希解析坐标。
而进入到大圣杯空间的就是只有御三家的初代家主，也就是爱因兹贝伦、玛奇里·佐尔根以及远坂永人。而现存于世的只有一个，就是玛奇里·佐尔根，也就是间桐脏砚。
解析空间坐标，自然不需要玛奇里·佐尔根的身体，只有有玛奇里·佐尔根的灵魂就可以了。因为长门有希解析空间坐标需要的是进入过大圣杯空间的物品就可以了。
而最好找的也就是玛奇里·佐尔根了。
凉宫春日虽然说现在没有长门有希在，但是凉宫春日却有着菈菈的发明暂时的替代长门有希。从玛奇里·佐尔根身上找到大圣杯空间的坐标。
不过就是有一点，长门有希解析坐标可以保全玛奇里·佐尔根，但是菈菈的发明就是不一定的了，毕竟玛奇里·佐尔根现在的状态不是人类。