维度共鸣震荡的硝烟未散，宇宙本源突然出现逆流现象。阿雷克斯的量子监测网络显示，构成万物的基础本源粒子开始逆向演化——夸克重组为更原始的能量形态，暗物质与暗能量剧烈对冲，连创生之树的根系都渗出黑色本源液体。莱娅的灵羽族圣地，所有古老预言石碑同时碎裂，露出底部血红文字：“本源倒转，文明归零”。全宇宙生命体的生命力开始流失，仿佛被某种力量抽离回宇宙诞生前的混沌。
苏尘与洛瑶的力量在本源逆流中产生异变。苏尘的混沌之力与逆向本源产生共鸣，他的身体逐渐透明，随时可能分解成原始能量；洛瑶的星光之力变得暗沉如血，治愈的光芒反而加速生命体的本源流失。两人的意识被卷入一个由破碎本源构成的混沌空间，这里漂浮着宇宙诞生与毁灭的记忆残片，中央悬浮着一座不断坍缩的本源核心，从中传出机械合成音：“回归初始，方得永恒。”
银河守望者联盟的舰队在试图稳定局势时，所有战舰的能源系统瞬间逆向运转，将储存的能量转化为虚无。船员们的身体开始从分子层面瓦解，逐渐化作发光的本源粒子。薇尔莉特带领的特遣队装备了“本源稳定器”，试图锚定自身存在，却发现装置反而成为加速逆溯的媒介，队员们的意识开始与宇宙诞生时的混沌意识相连，陷入疯狂边缘。
莱娅发动灵羽族最禁忌的“寰宇溯源”仪式，以燃烧全族千年传承为代价，揭开这场危机的真相。在宇宙诞生之初，十二工匠创造了“本源熔炉”，用于冶炼和塑造万物本源。但随着宇宙多次经历危机，熔炉核心的“逆溯之影”逐渐觉醒。它是所有文明对力量渴望的负面集合体，妄图通过逆转本源演化，将宇宙带回无序的混沌状态，从而掌控一切。
阿雷克斯带领科研团队启动“本源重铸计划”，在各个星域建造巨型“熔炉之心”。他们试图用量子纠缠技术捕捉逆向本源粒子，用灵羽族的净化咒文重塑正确演化路径。然而，逆溯之影不断扭曲法则，熔炉之心的能量输出反而加速了本源逆溯，咒文也被转化为加剧混乱的指令。普通星球上，山脉化作液态能量，海洋蒸发成虚无，所有生命都在本源逆流中痛苦消散。
苏尘与洛瑶在混沌空间中艰难前行，每走一步都要承受本源撕裂的剧痛。他们遭遇由逆溯本源具象化的恐怖存在：吞噬一切的混沌漩涡、操控能量逆流的暗之本源巨手、能将物质分解回初始状态的熵化巨像。逆溯之影在核心处发出刺耳的笑声：“抵抗吧，你们终将回归虚无！”两人在濒临崩溃的边缘，凭借对文明存续的执念相互支撑，在混乱中寻找逆转的契机。
关键时刻，全宇宙尚存的文明将最后的生命力与希望注入两人意识。苏尘与洛瑶将混沌之力、星光之力与文明的集体意志融合，形成能逆转本源逆溯的“创世火种”。当火种点燃本源核心，逆流的本源开始回归正轨，逆溯之影发出绝望的怒吼，身体逐渐崩解。但在消散前，它留下了恐怖的预言：“本源的轮回……不会终结……”
战后，创生之树生长出“本源监测根系”，自动监测并修复本源异常。苏尘与洛瑶的力量化作守护宇宙根基的永恒壁垒，他们的光芒成为抵御本源危机的最后防线。然而，在宇宙最黑暗的角落，逆溯之影的残念仍在悄然聚集，等待着再次掀起毁灭的狂潮……