三个月以后，区法院给长生进行了判决，林长生因故意伤害罪，处有期徒刑三年，赔偿牛大伟家医药费精神损失费38万元。
律师看守所见长生，给他的带来了家里面的消息，告诉他家长的一切都很好，判决完了之后，其他人都已回到老家去了，目前只有父亲在这等着你的申诉，你的姐姐文小芳你顺利的考上了美国的大学，现在已经到美国读书去了。牛大伟的左眼也没有完全失明，经过多家医院的救治，总算没有坏死，不用做眼球摘除手术，目前还有0.1的微弱视力。
律师对长生说：我在法庭上一直在给你做无罪辩护，我认为这是典型的正当防卫。但法院不采纳我的建议，坚持要定你故意伤害罪，你那个女朋友孙小睿帮了很大的忙，本来他们想判你5年，听说这个孩子直接找到了牛局长，在公安局大吵大闹，产生了一定的影响，所以在判决的时候，他们慎重了不少，折中了一下，到了这个结果并不是我们想要的，如果你不服我们可以申请二审，我个人也认为应该进行上诉。
林长生想了良久说：算了，这个结果不会有什么改变，他们既然执意要收拾我，已经把我关了三个多月了，不判是不可能的了，我也确实把牛大伟的眼睛给打坏了，三年牢狱之灾，换他一只眼睛，就这样子扯平了吧，只要他以后不再找我什么麻烦就行了。
律师问：就这样子不上诉了？
长生说：就这样吧，我认了。
律师说：孙小睿让我带话给你，让你一定要上诉，他会全力帮助的。
长生说：你代我谢谢他的好意，让他不要再折腾了，好好的努力学习，让他不要再有什么心理负担，这事与他无关。
律师说：你还有一个同学叫张小苗，你的笔记本电脑和资料他替你收拾保管好了，目前放在他的出租屋内里，你出来以后找他要。
长生说：那些东西都不重要了，随他去吧，扔了也无所谓。
孙小睿见林长生不上诉了，心中十分着急，他让母亲托关系让他进去见林长生一面，母亲拗不过她，只好再次找人，让孙小睿到看守所与林长生见上一面。
一见面孙小睿就问长生：你为什么不申诉？明显的，他们在用他父亲手中的权力报复你，你要上诉啊，我律师都给你请好了，现在不上诉，一切都完了。
林长生说：算了，小瑞，牛大伟用他的一只眼睛换我三年的牢狱之灾，我们之间扯平了。你要不要再折腾了，也不用内疚，这个事情与你无关，这也许就是我的命，我命中该有这一劫，你现在应该好好的在科研组学习和研究，将来考上研究生，成为一名出色的工程师。
孙小睿说：我现在哪有那心思？你出事以后我就退出了研究组。我现在非常后悔当初为了和你在一起，想方设法进研究组，没想到把你害成这样。牛小伟那个王八蛋，他就是一个恶魔，看着文质彬彬的，没想到内心却那么阴暗，把你也害了，把他哥也害了，把他自己也害了，现在学校都知道他的事，纷纷为你鸣不平，整个学校都没人理他。
长生说：你怎么能退出研究组呢？这是多好的机会和平台呀。
孙小睿说：我进研究组的目的就是为了你，现在把你害成这样，哪还有脸继续待在研究组？
林长生说：小瑞，不要因为我的事而影响你。你没想想吗？我们俩已经不在一个平台，不在一个起跑线了，你还是忘了我吧。
孙小睿哭着说：长生，你千万不要放弃自己，我等你。我这辈子就爱过你一个人，不管你怎么样，我都会等你。你就是到了监狱，我也会追过去，我欠你的太多了，我将用一生来弥补。你千万不要自暴自弃，现在申诉期已过了，你就安心的在监狱，保证好身体，我会去看你的。
林长生也知道自己劝不了这个倔强的女孩，他也不再说什么了。他内心在想：这也许是孙小睿目前的想法，等他认清了事实，认清的两人目前的差距，自然会远离他的。他就当与孙小睿之间是一个误会。他的小芳姐应该不会抛弃他。
长生转移了这个话题，对小瑞说：常教授他们怎么样？科研组现在在研究什么东西？
小瑞说：你出事以后，常教授感觉老了许多，头发也白了许多，他也没有心思在进行研究了，这个暑假也没有带我们去实地考察，我有三个多月没有去科研组，不知道他们在研究什么？
长生问：你知道张小苗现在在哪不？他是准备回新疆还是留在省城长沙工作。
小瑞说：我和张小苗见过几次？他应该是留在了长沙，他和那个在师范学院的女生好像在一起，看得出来他很关心你。
小瑞看了看林长生额头上的伤疤，问长生：这额头上怎么还留下个伤疤，还疼不疼？
长生用手摸了摸额头上的伤疤说：疼是不疼了，外伤好了，内伤却远存，破相了。左晚苦涩的笑了一下。
小瑞说：过几天你就要去监狱了，我让我爸给你打个招呼，让你在里面轻松一些。
长生说：大可不必，我已经充分做好了吃苦受累的准备，就当对自己的一种考验，我不相信我在里面会生活的比别人差。如果你真的想帮我，不如托人给我带点书进来，在长沙，也只有你知道我喜欢看什么书，需要看什么书？
老姜过来找长生，又谈了一次话。老江说：小伙子，我要退休了，临走之前过来看看你，看你精神状态还不错，身体已经完全恢复了。
长生说：谢谢你，姜叔，一时的冲动给我造成了这么严重的后果，现在的结果我也接受了，我必须面对事实，你就放心吧。我再不会乱来了，我要好好的活着，活出一个样来。
老江说：那我就放心了，我从警42年，见到的事情太多了，罪大恶极的，冤枉的，形形色色的人都有。但只要一个人不放弃自己，三年算什么？就当给自己一种历练，再去充实充实，监狱也是一所大学，里面有许多外面学不到的知识，你还年轻，这个时候吃这么大一个亏，对整个人生也不一定是个坏事，今后要慎言慎行，学会方圆处事之道，多学一点法律，多吃一点苦，多受点罪，在监狱里吸取其他犯人的经验教训，这对你这么聪明的大学生来说，将来的空间也许比别人更高，你是从坑里爬出来的，根基生，将来才长得茂盛，只要你恢复自信，我相信你的将来不会太差。
长生说：这几个月来确实感触挺深，我当时那种想法实在是太危险了，如果不是你们帮我一把，我真的就没有未来了，现在我想明白了，我不能自我放弃，我还有那么多的家人，是他们唯一的希望，我真不敢想象，没有了我他们该怎么活？
老姜说：看了这几个月也没有白待，你想明白这一层也是一种巨大的收获，许多人一辈子都不明白家人的意义，与亲人朋友勾心斗角，在利益面前损失亲情，枉为一世人，他们活得糊涂，活得卑微，不明白生活的真谛，我希望你用三年的时间，好好体验亲情。监狱是改造人的地方，里面的条件自然是艰苦，你要学会苦中作乐，不要害怕艰苦，许多伟大的人物，都是在监狱艰苦的环境中领悟到许多哲理，为你出狱后的生活打下坚实的基础，监狱的生活有两种，一种是自甘堕落，一种是绝处重生。
没过几天，林长生被送到了监狱。他正式成为一名囚犯。虽然林长生心理有充分的准备，监狱里面恶劣的环境和复杂的人际关系着实给林长生带来了不少困难。
他首先要面对狱霸的霸凌，其次要面对劳动的艰辛。当然更大的困难是他需要面对巨大落差的心理承受力。这对之前从小家境优越，从来没有参加过劳动，从来没有受过苦难的林长生来说，每一项都是巨大的挑战。
强者，在哪里都是强者。面对狱霸的霸凌，林长生选择了忍让，不和他正面起冲突，逐渐寻找自己的帮手。他联合贪污犯老马燕生。同样因打架入狱的退伍军人大兵，经常被人家欺负的小偷猴子。在得到民警的支持后，找到一个合适的机会后，直接把那个狱霸干得起不了床，脸肿的像猪头，几人还被民警关进了小屋子。林长生从这次行动中充分体会到，在这个复杂的社会上，必须谋定而后动，干什么事情必须要有计划？这是老马教他的。
准确的说，老马才是他们这个队伍的核心，林长生只是他的徒弟，老马因为年纪大，体力不足，在这种复杂的环境下，必须要有几个自己能依靠的人。有头脑的林长生，战斗力强悍的大兵，灵活机智的猴子并围绕在老马身边。互相帮助，共同战斗，使得别人不再敢欺负他们。
在老马的指导下，他们四人和狱警的关系处理的相当好，当然老马也有着非比寻常的人脉关系，经常会收到一些稀缺的生活用品。相比人际关系的处理，监狱里面的劳动改造对林长生来说，就要显得简单的多了。做饭，种菜，踩缝纫机，盖鸡卷，盖猪圈林长生都参加过。
家人会定期来看望长生，孙小瑞也基本上每半年来一次，每次来都带着许多的书籍和生活用品，这让他在不用劳动时，可以通过看书来忘却目前的环境。老马也有很多书，经常借给林长生看，老马也会指导他许多问题。