其实从很久以前，食蜂操祈就料到大蛇丸会参与到宇智波一族的灭族事件中，至于原因是多方面的。
首先，自然是身为科学家，大蛇丸对于宇智波一族血统的好奇。作为忍界最特别的两大家族，宇智波一族从二代火影开始便是木叶的研究重点。大蛇丸作为二代火影之后木叶最优秀的科学家，自然也知道宇智波一族的特殊性。
其次，则是食蜂操祈的蝴蝶效应。因为食蜂操祈的原因，大蛇丸和宇智波一族的关系远比原着中更加复杂。作为这个时空宇智波鼬的老师，同时也是宇智波一族曾经的盟友，大蛇丸即便和宇智波一族断绝关系，也会下意识关注宇智波一族的动向。
再者，便是河之国事件对大蛇丸的打击。相较于食蜂操祈玩弄人心的手段，被自己的弟子宇智波鼬用万花筒写轮眼打败，这对大蛇丸同样是巨大的打击。再加上宇智波一族原本就是木叶的研究重点，大蛇丸不管从那个方面，都必然会将大量精力放在宇智波一族上。
如今宇智波一族因为食蜂操祈的原因，再次被推到木叶内部的风口浪尖。虽然宇智波一族没有意识到木叶高层的狠辣，但大蛇丸作为长期与高层接触的忍者，自然能猜到木叶高层已然准备开始灭族的行动。
眼见宇智波一族这样珍贵的研究样本将会从忍界消失，再加上宇智波一族与自己的关系，食蜂操祈猜测大蛇丸几乎有几率会亲自潜入木叶村中，想办法参与到木叶高层和宇智波一族的博弈之中，以此谋求在木叶的内部博弈中获得最大的好处。
而且除了以上推测之外，火影原着的部分剧情也能佐证食蜂操祈的猜想。
原着中志村团藏那条满是写轮眼的手臂，便是大蛇丸帮忙研究的结果。而能够将那么多的写轮眼移植到同一条手臂上，足以看出大蛇丸进行了大量的人体实验。而实验样本，必然包含大量宇智波一族的忍者，或者说宇智波一族灭族后的尸体。
就是基于以上判断，食蜂操祈才会放弃中忍考试之前最后的训练时间，选择在一乐拉面店帮忙。因为食蜂操祈知道，大蛇丸如果潜入到木叶村中，九成九会想办法接近自己。而如果想接近自己，人多眼杂的一乐拉面店就是最好的地点。
事实证明，食蜂操祈的推测没有错误。
在中忍考试即将召开的前一刻，大蛇丸就这样大摇大摆地利用木叶的防卫空隙进入木叶，坐在一乐拉面店的餐桌上吃着拉面，同时与食蜂操祈通过幻术进行着交流。至于他主动找食蜂操祈的原因，食蜂操祈也不难推测。
一方面大蛇丸需要知道自己对这次宇智波事件的态度，另一方面他也希望借机蛊惑食蜂操祈脱离木叶。即便以上两个目的都不尽如人意，大蛇丸也可以与自己交换情报，或者干脆在行动之前干掉自己，铲除一个可能的威胁。
而同样的，此时的食蜂操祈也需要与大蛇丸合作。一方面借助大蛇丸的武力，保证自己在宇智波事件中的安全。另一方面食蜂操祈也希望通过大蛇丸这个桥梁，将晓组织的势力引入到这次木叶的内部斗争中。
对于食蜂操祈而言，她现在最大的劣势就是自身实力不足。所以为了让自己的战略主动性变得更大，食蜂操祈就需要不断引入新的变量。而原着中宇智波一族的灭族事件，明确表示了宇智波带土也是参与的一方。
既然宇智波带土参与了，但只要自己稍加干预，晓组织也参与这件事情也是顺理成章的事情。而只要晓组织参与进去了，宇智波一族与木叶高层之间的力量对比便会瞬间扭转，猿飞日斩便再也不可能像现在这样压制自己了！
就像之前食蜂操祈所谋划的那样，对付猿飞日斩，她可以无所不用其极。宇智波一族是她的一颗棋子，晓组织同样可以是！如果猿飞日斩以为这场棋局仅仅局限于火之国内部，那他就太天真了！
食蜂操祈这般想着，转而看向正在吃面的大蛇丸。就见此时的大蛇丸相较于雨之国，已然发生了脱胎换骨的变化。不只是气质和样貌发生了改变，原本断掉的右手也恢复如初。甚至从体味上看，她就连性别都发生了改变。
很显然，此时的大蛇丸已然完成了不尸转生的忍术。在雨之国被宇智波鼬重创之后，她已经将自己的灵魂转生到一个新的身体里。也是靠着这种脱胎换骨的变化，大蛇丸方才能轻易潜入木叶。因为除了食蜂操祈之外，任何人都无法想象面前这个从内到外都是女性的忍者，居然是三忍之一的大蛇丸。
“真是没想到，食蜂同学居然一瞬间就认出了我。要知道我现在这个模样，就连木叶村中许多老熟人都没认出来呢！”大蛇丸微微一笑，然后就道：
“不过毕竟是食蜂同学，你之所以在这么关键的时候还出来做拉面，就是在故意在等我吧？呵呵，你不必担心我的安危，现在的我与过去已经彻底发生改变。除了像食蜂同学这样精通人性的天才，就算是宇智波鼬和猿飞老师，也别想在第一时间认出现在的我。”
这般说着，大蛇丸又道：
“哦，对了，有一件事情你可能会感兴趣。猿飞老师的那个长子猿飞新之助，就是木叶现在的暗部部长，给我手下的药师兜传达了命令。他希望药师兜能在中忍考试中，以我的名义杀了你，然后将你的死嫁祸到我的头上。”
“呵呵，看得出来，猿飞老师很忌惮你呢！食蜂同学，我还是第一次看到猿飞老师这么针对一个12岁的下忍，你应该为这种重视感到荣幸。”
“荣幸？”食蜂操祈面上依旧在一乐拉面店中忙碌着，暗中却借助幻术道：
“我只觉得悲哀！好歹也是木叶的三代火影，这个年纪了居然还在玩儿借刀杀人的把戏。这是不甩锅就不会做事了吗？太腐朽，太陈旧，也太爱惜羽毛了！换做是我的话，直接让暗部动手就完事了。”
“真不愧是食蜂同学，很多方面你比猿飞老师看得透彻。作为火影，背负黑暗是必须的责任。猿飞老师确实太爱惜名声了，这就是为什么他会被你利用宇智波一族给逼成这样。”
听到大蛇丸说是自己谋划了宇智波一族的第二忍村计划，食蜂操祈心中暗道：
不愧是大蛇丸，果然猜到了事情的真相。
只是食蜂操祈面上却不露声色，而且有意转头瞥了瞥远处的树梢。向大蛇丸指明了隐藏在那里的木叶暗部，食蜂操祈继续用幻术道：
“自我从河之国回来之后，暗部的忍者就一直在监视我。火影大人确实爱惜名声，但他更担心我会威胁到他的火影宝座。所以我虽然有着类似的谋划，但在暗部全天的监视下，我根本没有施展的空间。”
听到食蜂操祈的推脱，大蛇丸并没有相信。因为大蛇丸与猿飞日斩一样，作为经验丰富的忍者，他们的直觉都告诉他们是食蜂操祈谋划了这一切。即便所有的证据都表明食蜂操祈没有引导宇智波一族的能力，可他们的直觉还是让他们相信食蜂操祈与这件事存在着关系。
不过就算如此，大蛇丸还是道：
“既然如此，食蜂同学，你说是谁替宇智波一族谋划了这一切呢？不要告诉我是宇智波富岳，如果他真的有这样的本事，第四代火影早就是宇智波一族的囊中之物了！”
对此，食蜂操祈没有明言解释，而是含糊其辞道：
“大蛇丸，我觉得这个问题的答案，你应该比我更清楚。”
“我？”
“对啊！看看你额头的护额，那是雨忍村的标志。据我所知，雨忍村可是半神半藏的村子。作为忍界最顶尖的影级强者之一，大蛇丸你不会随随便便就带上人家的护额，然后以雨忍的身份跑到木叶村吧？”
听到食蜂操祈的话语，大蛇丸的双眸微微眯起。
显然，此刻的他再次为食蜂操祈可怕的分析能力感到震惊。
仅仅是通过自己额头的护额，她便推测到自己这一次潜入木叶，不仅是个人原因，也与自己背后的雨忍村势力有关。虽然受限于下忍的身份，食蜂操祈并不知道半藏已死，现在的雨之国是晓组织做主。但这点瑕疵，反而让食蜂操祈的分析能力更加真实，也更加可怕。
“呵呵，食蜂同学。相比于河之国的隔空斗法，我发现与你面对面接触似乎更加恐怖啊！”
大蛇丸冷笑一声，随后道：
“不错，我这一次潜入木叶，不只是出于个人的兴趣，也是为了帮助雨忍村的势力搜集情报。只是有一点你猜错了，现在雨忍村做主的并非是半藏，而是一个名为‘晓’的组织。这个组织远比半藏要可怕得多，即便是我也是刚刚与这个组织接触。”
听到大蛇丸的解释，食蜂操祈微微颔首道：
“如此说来，一切都显得顺理成章了！”
什么就顺理成章了，你这小鬼又想到了什么？
在大蛇丸的疑惑中，食蜂操祈分析道：
“虽然我没有晓组织的具体情报，但从他们能干掉半藏这一点来看，这个组织的实力就不简单。而既然有着如此实力，晓组织却依旧选择蛰伏，这便可以看出这个组织一定隐藏着巨大的秘密。”
“虽然我不知道这个秘密是什么，但想来不会是帮助木叶维护忍界现有秩序。而既然晓组织的目的不是为了维护现有秩序，那这个组织的立场必然与现有秩序的维护者，木叶忍者村之间存在着对立。所以不管晓组织的最终的目的是什么，木叶都必然是这个组织的大敌。”
“在必然与木叶敌对的情况下，晓组织肯定会想办法通过各种手段削弱木叶村。而木叶高层和宇智波一族的对立，显然就是晓组织削弱木叶村的关键机会。只要能挑动宇智波一族与木叶高层之间的对立，引发木叶的内斗，不管最终哪一方获得了胜利，木叶的实力都会被削弱，晓组织作为幕后推手都是获利的一方。”
听到食蜂操祈的一通分析，饶是以大蛇丸的智商也思忖了片刻，随后道：
“食蜂同学的意思是，这次宇智波一族的第二忍村计划，是晓组织在暗中推动的结果？”
“不然呢？”食蜂操祈反问道：
“如今整个忍界，有可能推动这项计划的就那么几个人。不是我，又不是你大蛇丸，还能是谁？总不至于是宇智波斑死而复生了吧？所以排除所有的不可能，最有可能的便是这个深不可测的晓组织啊！”
“可是，第二忍村计划虽然会造成木叶高层和宇智波一族之间的极端对立，但同样会增强火之国的综合国力啊！火之国的国力增强了，晓组织不是会受到更加严重的打压吗？”
大蛇丸不解道：
“而且第二忍村计划如果真正实行了，宇智波一族和木叶高层之间的关系甚至会在一定程度上缓和。因为双方不在同一个忍者村了，关系也不会像过去那样针锋相对了！只要两大忍村之间没有流血冲突，晓组织的谋划不就是作茧自缚吗？”
“怎么能说是作茧自缚呢？大蛇丸，你的目光未免狭隘了点。”
我，目光狭隘？
大蛇丸活了四十几年了，还是第一次被人这么评价。
“你只看到了第二忍村可以增强火之国的实力，缓解宇智波一族与木叶高层之间的关系。你却没有想过第二忍村的建立，同样给了晓组织渗透进火之国内部的机会？试想宇智波一族如果当真脱离了木叶，单靠他们一个家族能够组建一个忍者村吗？肯定不能。”
“既然不能，宇智波一族必然会在忍村建立之前，召集各地的忍者加入新的忍村。而此时，晓组织只要借机派遣自家组织的成员加入新忍村，就可以在不知不觉间将这个新忍村掌控在自己手里。如此不仅能摆脱过去隐秘组织的身份，还可以获得火之国国力的支持。”
“甚至掌控了这个第二忍村之后，晓组织还能继续渗透。只要掌握了宇智波一族的力量，再加上晓组织原本就有斩杀半藏的实力，木叶还会是晓组织的对手吗？若是能在火之国的内斗中彻底压服木叶，晓组织甚至能间接掌控火之国这个忍界第一强国！”
“试想，作为一个目标远大的隐秘组织，是雨之国更有可能实现晓组织的野心，还是火之国更有可能实现晓组织的野心呢？而只要将火之国这个忍界第一强国掌握在手里，晓组织还有什么目的是办不到的呢？甚至就算是统一忍界，也不是不可能的吧！”
听完食蜂操祈的分析，大蛇丸直接呆愣在那里。
她思索了片刻，越想越觉得食蜂操祈的推断有道理。
因为食蜂操祈的推断不仅操作性强，而且即便没有完全实现目标，晓组织的实力也可以大大增强。可以说不管怎么算，晓组织都是赚的。
原来如此！
大蛇丸在心中发出了恍然大悟的呼喊：
我说晓组织怎么这么神秘，敢情他们玩儿的居然这么大！
他们居然想直接取代木叶，掌控火之国这个忍界第一强国！
亏我看到他们在搜集尾兽的资料，还以为这个组织是想搜集尾兽呢。现在看来，人家这只是掩人耳目的手段。与统一忍界的伟大战略相比，搜集尾兽什么的，实在是太小家子气了！